MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 5892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004041	GGC	2	6	91	96	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492964
2	NC_004041	GCC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492964
3	NC_004041	TCA	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492964
4	NC_004041	GGC	2	6	286	291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492964
5	NC_004041	AAC	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492964
6	NC_004041	CTG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492964
7	NC_004041	CGG	2	6	400	405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492964
8	NC_004041	TCA	2	6	429	434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492964
9	NC_004041	CGA	2	6	620	625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
10	NC_004041	CG	3	6	670	675	0 %	0 %	50 %	50 %	21492963
11	NC_004041	GAA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492963
12	NC_004041	GGC	2	6	851	856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492963
13	NC_004041	GGA	2	6	859	864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492963
14	NC_004041	GCC	2	6	880	885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492963
15	NC_004041	CGA	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
16	NC_004041	GCGA	2	8	914	921	25 %	0 %	50 %	25 %	21492963
17	NC_004041	GATTG	2	10	936	945	20 %	40 %	40 %	0 %	21492963
18	NC_004041	GCG	2	6	980	985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492963
19	NC_004041	GACT	2	8	1005	1012	25 %	25 %	25 %	25 %	21492963
20	NC_004041	CGC	2	6	1035	1040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492963
21	NC_004041	GGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492963
22	NC_004041	GGC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492963
23	NC_004041	CGA	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
24	NC_004041	TCA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492963
25	NC_004041	GAA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492963
26	NC_004041	ATC	2	6	1184	1189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492963
27	NC_004041	GCT	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492963
28	NC_004041	CGA	2	6	1209	1214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
29	NC_004041	GGT	2	6	1249	1254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492963
30	NC_004041	AGC	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
31	NC_004041	CGA	2	6	1302	1307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
32	NC_004041	CTT	2	6	1344	1349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492963
33	NC_004041	TCG	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492963
34	NC_004041	TGCC	2	8	1405	1412	0 %	25 %	25 %	50 %	21492963
35	NC_004041	GC	3	6	1427	1432	0 %	0 %	50 %	50 %	21492963
36	NC_004041	GCC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492963
37	NC_004041	CATG	2	8	1518	1525	25 %	25 %	25 %	25 %	21492963
38	NC_004041	CG	3	6	1527	1532	0 %	0 %	50 %	50 %	21492963
39	NC_004041	GC	3	6	1561	1566	0 %	0 %	50 %	50 %	21492963
40	NC_004041	CAT	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492963
41	NC_004041	GCA	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492961
42	NC_004041	TCG	2	6	2514	2519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492961
43	NC_004041	GGT	2	6	2546	2551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492961
44	NC_004041	TCC	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492961
45	NC_004041	CATGC	2	10	2585	2594	20 %	20 %	20 %	40 %	21492961
46	NC_004041	CAT	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492961
47	NC_004041	CGC	2	6	2639	2644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492961
48	NC_004041	GC	3	6	2716	2721	0 %	0 %	50 %	50 %	21492961
49	NC_004041	GCCG	2	8	2749	2756	0 %	0 %	50 %	50 %	21492961
50	NC_004041	CGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492961
51	NC_004041	GAT	2	6	2794	2799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492961
52	NC_004041	AAG	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492961
53	NC_004041	CGA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492961
54	NC_004041	GACGA	2	10	2969	2978	40 %	0 %	40 %	20 %	21492961
55	NC_004041	CTT	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492961
56	NC_004041	GGC	2	6	3004	3009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492961
57	NC_004041	TAT	2	6	3017	3022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492961
58	NC_004041	AG	3	6	3191	3196	50 %	0 %	50 %	0 %	21492961
59	NC_004041	GC	3	6	3232	3237	0 %	0 %	50 %	50 %	21492961
60	NC_004041	ACC	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492961
61	NC_004041	GCTC	2	8	3319	3326	0 %	25 %	25 %	50 %	21492961
62	NC_004041	CAG	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492960
63	NC_004041	GGCAAT	2	12	4552	4563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21492960
64	NC_004041	GCC	2	6	4565	4570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492960
65	NC_004041	TCA	2	6	4578	4583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492960
66	NC_004041	CGA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492960
67	NC_004041	TGC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492960
68	NC_004041	CGT	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492960
69	NC_004041	CGC	2	6	4894	4899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492960
70	NC_004041	CGC	2	6	5031	5036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492960
71	NC_004041	TGAC	2	8	5069	5076	25 %	25 %	25 %	25 %	21492960
72	NC_004041	TCGA	2	8	5089	5096	25 %	25 %	25 %	25 %	21492960
73	NC_004041	TTG	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492960
74	NC_004041	AGT	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492960
75	NC_004041	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255299
76	NC_004041	GAG	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255299
77	NC_004041	TCG	2	6	6183	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255299
78	NC_004041	GCCC	2	8	6320	6327	0 %	0 %	25 %	75 %	89255299
79	NC_004041	CAG	2	6	6368	6373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255299
80	NC_004041	CCG	2	6	6428	6433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
81	NC_004041	TCC	2	6	6498	6503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255299
82	NC_004041	AGG	2	6	6623	6628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255299
83	NC_004041	G	6	6	6627	6632	0 %	0 %	100 %	0 %	89255299
84	NC_004041	CAGG	2	8	6634	6641	25 %	0 %	50 %	25 %	89255299
85	NC_004041	TTCC	2	8	6670	6677	0 %	50 %	0 %	50 %	89255299
86	NC_004041	TCG	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255299
87	NC_004041	ATC	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255299
88	NC_004041	CGT	2	6	6761	6766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255299
89	NC_004041	CGA	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255299
90	NC_004041	GCC	3	9	6878	6886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
91	NC_004041	CGG	2	6	6900	6905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255299
92	NC_004041	TGA	2	6	6922	6927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255299
93	NC_004041	CGC	2	6	6928	6933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
94	NC_004041	CCG	3	9	7008	7016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
95	NC_004041	CGG	2	6	7208	7213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492958
96	NC_004041	AGC	2	6	7217	7222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
97	NC_004041	CGC	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
98	NC_004041	CTT	2	6	7286	7291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492958
99	NC_004041	ACA	2	6	7326	7331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
100	NC_004041	GGT	2	6	7372	7377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492958
101	NC_004041	GC	3	6	7407	7412	0 %	0 %	50 %	50 %	21492958
102	NC_004041	A	6	6	7413	7418	100 %	0 %	0 %	0 %	21492958
103	NC_004041	ACG	2	6	7450	7455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
104	NC_004041	GAC	2	6	7469	7474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
105	NC_004041	GTG	2	6	7584	7589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492958
106	NC_004041	GCC	2	6	7639	7644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
107	NC_004041	T	6	6	7789	7794	0 %	100 %	0 %	0 %	21492958
108	NC_004041	ACG	2	6	7829	7834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
109	NC_004041	CGCA	2	8	7909	7916	25 %	0 %	25 %	50 %	21492958
110	NC_004041	TAT	2	6	7934	7939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492958
111	NC_004041	GAT	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
112	NC_004041	CA	3	6	7954	7959	50 %	0 %	0 %	50 %	21492958
113	NC_004041	CGA	2	6	7980	7985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
114	NC_004041	GATC	2	8	8046	8053	25 %	25 %	25 %	25 %	21492958
115	NC_004041	GCC	2	6	8112	8117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
116	NC_004041	CGG	2	6	8118	8123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492958
117	NC_004041	GGCGA	2	10	8164	8173	20 %	0 %	60 %	20 %	21492958
118	NC_004041	CATC	2	8	8273	8280	25 %	25 %	0 %	50 %	21492958
119	NC_004041	GCCG	2	8	8355	8362	0 %	0 %	50 %	50 %	21492958
120	NC_004041	TGTT	2	8	8366	8373	0 %	75 %	25 %	0 %	21492958
121	NC_004041	CAA	2	6	8442	8447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
122	NC_004041	ATG	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
123	NC_004041	TGA	2	6	8622	8627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
124	NC_004041	AGC	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
125	NC_004041	TGG	2	6	8735	8740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492958
126	NC_004041	CCGT	2	8	8765	8772	0 %	25 %	25 %	50 %	21492958
127	NC_004041	GCC	2	6	8812	8817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
128	NC_004041	CAA	2	6	8838	8843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
129	NC_004041	CCG	2	6	8865	8870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
130	NC_004041	CAA	2	6	8916	8921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
131	NC_004041	TGA	2	6	8933	8938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
132	NC_004041	GAC	2	6	8944	8949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
133	NC_004041	GA	3	6	8991	8996	50 %	0 %	50 %	0 %	21492958
134	NC_004041	AGG	2	6	9026	9031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492958
135	NC_004041	GCGA	2	8	9104	9111	25 %	0 %	50 %	25 %	21492958
136	NC_004041	GC	3	6	9196	9201	0 %	0 %	50 %	50 %	21492958
137	NC_004041	ATCA	2	8	9202	9209	50 %	25 %	0 %	25 %	21492958
138	NC_004041	GAA	2	6	9226	9231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492958
139	NC_004041	GGCT	2	8	9256	9263	0 %	25 %	50 %	25 %	21492958
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170	NC_004041	GAGT	2	8	11121	11128	25 %	25 %	50 %	0 %	21492956
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256	NC_004041	AAG	2	6	16656	16661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492954
257	NC_004041	CGAC	2	8	16666	16673	25 %	0 %	25 %	50 %	21492954
258	NC_004041	CCA	2	6	16775	16780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492954
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261	NC_004041	GTT	2	6	16872	16877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492954
262	NC_004041	AAAG	2	8	16974	16981	75 %	0 %	25 %	0 %	21492954
263	NC_004041	A	6	6	17402	17407	100 %	0 %	0 %	0 %	21492953
264	NC_004041	TCGC	2	8	17502	17509	0 %	25 %	25 %	50 %	21492953
265	NC_004041	GTT	2	6	17608	17613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492953
266	NC_004041	CGA	2	6	17671	17676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492953
267	NC_004041	GCCG	2	8	17704	17711	0 %	0 %	50 %	50 %	21492953
268	NC_004041	GAA	2	6	17734	17739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492953
269	NC_004041	CAG	2	6	17808	17813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492953
270	NC_004041	GGT	2	6	17831	17836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492953
271	NC_004041	AGAGG	2	10	17841	17850	40 %	0 %	60 %	0 %	21492953
272	NC_004041	GGT	2	6	17863	17868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492953
273	NC_004041	GCG	2	6	17876	17881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492953
274	NC_004041	CGAT	2	8	17952	17959	25 %	25 %	25 %	25 %	21492953
275	NC_004041	A	6	6	18262	18267	100 %	0 %	0 %	0 %	21492952
276	NC_004041	GCT	2	6	18350	18355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492952
277	NC_004041	GAG	2	6	18368	18373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492952
278	NC_004041	CAGTGC	2	12	18408	18419	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21492952
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280	NC_004041	GGT	2	6	18506	18511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492952
281	NC_004041	ATG	2	6	18537	18542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492952
282	NC_004041	CG	3	6	18575	18580	0 %	0 %	50 %	50 %	21492952
283	NC_004041	GCA	2	6	18593	18598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492952
284	NC_004041	GCTC	2	8	18944	18951	0 %	25 %	25 %	50 %	21492951
285	NC_004041	CGC	2	6	18954	18959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492951
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288	NC_004041	TGA	2	6	19083	19088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492951
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292	NC_004041	ATCG	2	8	19451	19458	25 %	25 %	25 %	25 %	21492951
293	NC_004041	TGG	2	6	19572	19577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492951
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394	NC_004041	ATC	2	6	25181	25186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255302
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